Свои задачи Институт выполняет в организационно-штатной структуре, включающей директора, аппарат заместителей, научно-исследовательские, научно-вспомогательные, организационно-методические, административные и хозяйственные подразделения.

• Руководство Института

Научно- исследовательские и организационно-методические подразделения представлены следующим образом:

• Научно-организацирнный отдел
• Отдел международных проектов
• Отдел контроля качества
• Клинический отдел
• Отдел химии
• Лаборатория информационных технологий
• Лаборатория гигиены труда
• Лаборатория экологической токсикологии
• Лаборатория лекарственной безопасности
• Лаборатория промышленной токсикологии
• Лаборатория иммунологии
• Лаборатория патоморфологии